Säätiö saa rahoituksensa pääosin valtionapuna. Lisäksi Alko tukee säätiötä. Säätiö on tutkimuksellisesti autonominen.
Säätiön hallituksen jäsenistä sosiaali- ja terveysministeriö nimittää neljä, Tieteellisten seurain valtuuskunta neljä ja valtion alkoholiyhtiö Alko yhden. Hallituksen enemmistön tulee olla alkoholikysymykseen perehtyneitä ansioituneita tieteenharjoittajia.
Säätiö toimii läheisessä yhteistyössä Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen (THL) Hyvinvoinnin ja terveyden edistämisen yksikön kanssa. Tutkimusjohtaja on säätiön ainoa vakinainen toimihenkilö, mutta säätiön ja THL:n välisen sopimuksen mukaisesti THL antaa säätiölle hallinnollista ja teknistä apua.
Hallituksen käsiteltäviksi tulevat asiat valmistelee työvaliokunta, joka valitaan hallituksen tutkijajäsenistä. Säätiön vuosiksi 2026–2028 valittujen toimielinten kokoonpano on seuraava:
Puheenjohtaja: Pertti Alasuutari, professori emeritus
Varapuheenjohtaja: Pia Mäkelä, tutkimusprofessori
Jäsenet:
Jonna Björklund, Head of Legal and Compliance
Jussi Kauhanen, professori
Elina Kotovirta, VTT
Anne Kouvonen, professori
Solja Niemelä, professori
Jaana Rysä, professori
Terhi-Anna Wilska, professori
Puheenjohtaja: Pertti Alasuutari, professori emeritus
Jäsenet:
Anne Kouvonen, professori
Jaana Rysä, professori
Terhi-Anna Wilska, professori
Tutkimusjohtaja:
Tomi Lintonen, dosentti